1953년 9월 15일 창립됐으며, 평양시 서성구역 버드나무거리 장경 2동에 위치하고 있다.
1976년 9월 16일 사회과학출판사, 과학출판사, 의학출판사, 백과사전출판사를 통합하여 '과학, 백과사전출판사'로 명칭이 바뀌었다가 87년 7월 23일 과학백과사전종합출판사로 확대되면서 산하에 사회과학출판사, 과학기술출판사, 의학과학출판사, 백과사전출판사를 두고 있다.
2001년 7월 또다시 '과학백과사전출판사'로 개명됐다.
역사과학, 철학연구, 문화어학습 등 30여종의 정기간행물을 발행하고 있으며 2002년 전30권의 '조선대백과사전'을 출간했다.
최근 사장 겸 책임주필이 김영일에서 김중협으로 교체됐고 부사장으로 리민철, 정영근, 김문성 등이 활동 중이다./연합